由于五蓮紅門牌石本身含有赤鐵礦或硫鐵礦等，此類鐵礦物本身易被氧化而銹蝕，造成五蓮紅門牌石表面變色和銹斑等病變，嚴重者甚至因鐵質銹蝕后產生結晶顆粒爆裂。下面就含鐵礦物對各五蓮紅門牌石的影響逐項說明。

含鐵礦物對花崗巖的影響除了含鐵硫酸鹽礦物外，大部分的含鐵礦物都有可能以各種化學分子式的形式存在花崗巖中。含鐵礦物中屬硅酸鐵礦物的數量及分布廣，其次是氧化鐵。含鐵礦物顏色的深暗，對花崗巖的裝飾美觀價值有關鍵性的影響。

硫化鐵是花崗巖遭受銹黃污染的主要原因，硫化鐵在常溫常壓下易風化水解，先生成氧化鐵，然后水化成褐鐵礦。硫化鐵分解后會留下立方體黃鐵礦假象，有的溶蝕成許多孔洞。若氧化鐵溶液沿著裂隙滲透浸染，從而形成鐵質薄膜，使五蓮紅門牌石遭受污染，降低五蓮紅門牌石光澤度影響裝飾。

花崗巖中遭受破壞的第二原因為黑云母，片狀組織很容易沿此面剝離且易風化，形成小坑。